Fondo Olivier Debroise
Donado por el curador, crítico e historiador del arte Olivier Debroise, el fondo está constituido principalmente por fotografía. Consta de 479 piezas entre las que destacan platas sobre gelatina de la fotógrafa Lola Álvarez Bravo, un juego de 18 números de la revista El Fotógrafo Mexicano, así como fotografías y albúminas del siglo XIX.
Fondo Roberto Montenegro
Adjudicado al MUNAL en el año 2000, la colección está conformada por 450 piezas de arte popular mexicano como máscaras, juguetes, cerámicas, textiles y vasijas, entre otros.
Fondo Amador Lugo Guadarrama
Donado al Instituto Nacional de Bellas Artes e integrado al MUNAL en 1999, el fondo se conforma por 521 obras, primordialmente de Lugo Guadarrama durante su periodo en la Escuela de Pintura al Aire Libre de Taxco y su tránsito por el Taller de Grabado de la Escuela Nacional de Artes del Libro.
Fondo Julio Castellanos
Adquirido en 2010 por el Instituto Nacional de Bellas Artes y Literatura, fue transferido del CENCROPAM al MUNAL en 2012 y es constituido por 307 piezas. El fondo se caracteriza por sus bocetos escenográficos y sus diseños de vestuario realizados entre 1928 y 1947.
Fondo Carlos Pellicer
Donado al MUNAL en 2022 por Carlos Pellicer López, sobrino del poeta, este acervo resguarda 2077 obras, de las cuales 1426 son autoría del artista Mario Alonso Ostaloza y 651 son óleos, acuarelas, fotografías, dibujos y esculturas de artistas de los siglos XIX y XX.
Fondo Félix Parra
Adquirido por el Instituto Nacional de Bellas Artes y Literatura en 2008, este fondo quedó bajo el resguardo del MUNAL a partir del 2010. Está integrado por 444 piezas, de las cuales 217 son obras plásticas y 227 objetos personales y documentales del artista, entre los que destaca su epistolario familiar.
Fondo Luis G. Serrano
Donación clasificada en dos rubros: el acervo artístico donado en 2008 y conformado por 250 piezas entre óleos, acuarelas y dibujos; y el acervo documental, donado en 1995 e integrado por 479 expedientes que resguardan libros, cartas, apuntes, recortes, revista e investigaciones del artista.
Fondo María Asúnsolo
Donación realizada en tres momentos: 1987, 1988 y 1993; integrada por 49 piezas: 44 obras plásticas que incluyen óleos, acuarelas, dibujos, grabados, fotografías y esculturas; así como 5 álbumes fotográficos, epistolares y hemerográficos de la promotora cultural María Asúnsolo. Destacan los retratos que le realizaron David Alfaro Siqueiros, Juan Soriano, Diego Rivera, Federico Cantú y Emiliano Di Cavalcanti.
Fondo Ricardo Pérez Escamilla
Adquirido en 2010, se encuentra dividido en dos rubros: el hemerográfico, que se preserva en la biblioteca del museo; y el gráfico, que consta de 1505 piezas, que se resguardan en las bodegas del recinto, entre las que destacan las litografías del siglo XIX.
Fondo Elsa Rogo
Donación realizada en 2011 por el investigador y curador James Oles, constituida por 377 obras artísticas de diferentes técnicas, de las cuales 366 son acuarelas, 2 son dibujos y 9 grabados. Además, cuenta con un archivo documental de 88 piezas, 29 fotografías y 59 documentos, sobre los proyectos binacionales de las Escuelas de Pintura al Aire Libre.